Hola,
Si instalas ARKITool como administrador y luego quieres trabajar con otro usuario debes hacer lo siguiente:
Como administrador: Ves al registro de Windows y exporta la clave HKEY_CURRENT_USER\Software\Ideas y Programas, S.L.\ARKITool 2011.
Abre como el usuario normal: Importa el registro que exportaste antes. Haz doble clic sobre el archivo para importalo al registro de Winwdows.
Con eso ya te funcionará ARKITool 2011 con el usuario normal.
Saludos.